Постриженик Печерського монастиря.. За переказом, народився в Києві. Ряд документів свідчить про відвідування святим Ніфонтом Царграда (Константинополя). Постригся в Печерському монастирі за ігумена Тимофія (1124-1132). 1130 року Ніфонт був висвячений на єпископа Новгородського. Прийшов у єпархію заслуженою і відомою у Церкві людиною. Зарекомендував себе як гідний архієрей, палкий і безкомпромісний захисник церковних канонів. Згідно з новгородським літописом, ним побудовано в Новгороді 10 церков, а також храм Климента в Ладозі.
Прп.Ніфонт користувався надзвичайною повагою також і поза межами своєї єпархії, що дозволяло йому виконувати роль посередника у суперечках між руськими князями. 1135 року угамував конфлікт між Мономаховичами і Ольговичами на півдні Русі. 1149 року Нифонт виступив проти неканонічно поставленого митрополита - Клима Смолятича, за що був засланий київським князем Ізяславом Мстиславичем у Печерський монастир. Восени 1155 р. на Русь було призначено нового канонічного митрополита - грека Костянтина. Прп Ніфонт, який мав зустрічати його в Києві, несподівано занедужав і 21 квітня 1156 р. помер.
Поховали владику в печері прп.Феодосія.
Пам'ять 11 жовтня і 21 квітня.